Es que alien no es un "método mágico" para crear paquetes... para hacer el paquete deb, se necesita algo para hacer el paquete, es decir, unas reglas, algo que diga donde descomprimir las cosas, que cambios hacer en el sistema, la información del paquete, etc.
Y en el paquete de firefox, no hay nada de eso (que yo sepa). Aún así, puedes ejecutar firefox sin integrarlo con el sistema, con el ejecutable que hay dentro del paquete.
Un saludo.