a mi me pasaba lo mismo.
al final lo he conseguido borrando de la wii la sincronización con los mandos y volviéndolo a sincronizar los mandos desde cero.
El proceso exacto fué:
1. Reiniciar la wii, y en la pantalla negra inicial con el aviso, pulsar 20 segundos el botón rojo.
2. Una vez hecho eso, pulsar el botón rojo del mando, e inmediatamente después, volver a pulsar el botón rojo de la consola (pero sólo una pulsación , no hace falta quedarse pulsando como en el paso 1).
después de hacer eso, sin problemas.