ya está, ya lo he solucionado.
el disco duro lo tenia ya en FAT32... el problema era que los juegos los pasaba de uno en uno desde el disco C (el del ordenador) y de ahi lo pasaba al disco duro externo y que copiaba solamente un archivo ul.cfg del primer juego, creyendo que solamente hacia falta ese archivo para hacer funcionar a los juegos, porque claro, cada vez que hacia un juego me salia un ul.cfg y tenia que substituirlo cuando los pasaba al externo, entonces por eso solo me pillaba el primero... y otro error era que los copiaba primero al disco C y de ahi los pasaba al externom cuando lo que hay que hacer es pasarlos directamente al externo para que se acumulen los juegos en el ul.cfg y no de conflictos como me ha pasado ami.
esa es la solucion, por si a alguien le ocurre lo mismo o no sabe como pasar los juegos.. con el USB util es mejor para un disco externo, pasar los juegos directamente a la raiz del externo. ya me salen todos los juegos
PD: Yo no he desfragmentado nada y me va bien
saludos