Hola,
todos los problemas que relatas sobre los juegos son totalmente anormales.
Para empezar no sé como formateaste el disco duro, si lo hiciste con la
opción del uLE o con la del winhiip mejor que no, vuelve a formatearlo
con el HDL 0.8c que hay en el hilo del Freemcboot 1.8c comenzado de
nuevo desde cero.
Las imágenes creadas de los juegos para instalarlo que sean hechas con
los programas UltraISO o ImgBurn que son los recomendados, y no cualquier
otro, porque sino los juegos pueden estar mal.
No uses para nada el winhiip, sus opciones de reparación pueden dejarlo peor, ni se
deben mezclar instalaciones hechas con uno y otro programa, instala solo con el
HDLDump Helper GUI.
Si tienes un modchip desactívalo por completo porque los hay que
interfieren en el correcto funcionamiento del disco duro.
También podría tratarse de una incompatibilidad con ese disco duro,
sería ideal poder probar otros discos duros para descartarlo.
El jumper del disco duro debe estar en la posición de Master cuando
está en la PS2.
Comprueba que el adaptador de red haga bien el contacto cuando está
atornillado, puesto que ya le ha pasado a algunos que se trataba de eso.
Modificar la velocidad DMA del disco duro está disponible en las versiones
de HDL que se lo hayan añadido, y en el OPL a partir de la versión 0.7, pero
ello no arregla los juegos y problemas comentados.
Ninguno de los juegos que mencionas necesitan de Modos, consulta la
lista de compatibilidad con el disco duro interno que hay bien visible en el foro.
Saludos.