Bueno, suponiendo en primer lugar que no te hayas liado y sea como todos pensamos que es, lo primero que deberias hacer es hacerte a la nueva situacion, aceptarla como que es algo que podia pasar y ha pasado, asumirlo vamos. Supongo que a estas alturas ya lo habras hecho. Son cosas que pasan y tus padres van a seguir queriendote igual que antes, simplemente la relacion entre ellos va a pasar a ser de amistad, la relacion respecto a vosotros sera la misma, y seguro que haran lo posible por que lo noteis lo minimo una vez este todo aclarado.
Respecto a la situacion intermedia en que estas en estos momentos, en mi opinion deberias ir directo a tu padre, decirle que sabes lo que sucede, y que se sincere contigo. Esto cuanto antes lo hagas antes te quitas el peso de encima. Una vez oigas la opinion de tu padre, ya dependiendo de como sea ya actuaria. Si se trata de algo serio o se trata de un "desliz", si esta dispuesto a aclararlo todo ya o prefiere esperar. En la mayoria de los casos deberias pedirle que lo hablen ya, o lo hablaras tu, con lo que aceptara aclararlo todo. Y a partir de ahi a apoyar a tu madre esos dias, que seran los mas duros.
PD: Siento hablar tan claro, pero es lo mejor.