Un switch, no en vano, no deja de ser un re-amplificador de señal, así que pudiera ser que la señal de router sea débil, que el cable sea malo y que al conectarlo directamente al router, entre la señal y que el cable tiene pérdidas, no pueda establecerse negociación y, por tanto, sincronía en la conexión (link caído).
Tal vez el cable bueno es el que va del router al switch.
Prueba con otro cable mejor apantallado (resistente a interferencias y pérdidas).
De todas formas, no das detalles. Igual estás con un CAT-6 STP y lo que te digo no te sirve de nada. O igual estás con un cable de 4 hilos de tu operador, que los hay, y luego pasa lo que pasa.
Por cierto, el puerto será RJ-45. Otra cosa es que esté preparado para STP (masa) o sólo UTP.