Bienvenido,
1- La lista es para HDLoader asique puede haber pequeños cambios con respecto al HDAdvance, en cualquier caso si te funciona sin modos no te preocupes (En caso de que mas adelante el juego diese algun fallo, prueba activando el modo 3)
2- Hay que resetear siempre la consola (ya se que es un coñazo levantarse, pero...)
3- Si, da igual el disco que utilices. En el disco va lo mismo grabado solo que si tu lente no lee bien CDs tendras ue utilizar el DVD o viceversa (Creo que esto es asi, si estoy equivocado que alguien me corrija)