Recomiendo leer softmodmii para saber de que va, y luego usar modmii, que está actualizado. Supongo que instala los últimos loaders, aunque hace tiempo que no lo uso. El tema de cios no se ha movido desde entonces,
Recomiendo usb loader cfg (mod) porque te mueves por la lista moviendo el wiimote, hace búsquedas por tipo de juego y tiene selección de cios automático. Para emuladores, parece mejor wiiflow.
Últimos cambios desde hace 1 año aprox: nintendont (sigue muy activo), loaders para darle soporte, retroarch, mgba (útil para juegos de gba de ritmo), priiloader (0.8), wiisxr (no he notado mejoría y empeora la gestión de archivos), wimmfi (servidor para algunos juegos on line), canales y servidores de nintendo cerrados.
Es muy recomendable una emunand para guardar los datos en el mismo disco (usb2) de los backups, para guardar los datos ahí, en vez de en la wii.
Desde modmii se usa la opción uneek-di, con el mismo serial de la wii, y en el loader marcar "emulación parcial". Con algunos no funciona, pero hay algunos que usan 100 sectores, o descargas. Y para wiiware/vc.
La mejor opción es instalar priiloader y que cargue el loader directamente.