Variar, te variará porque no es la misma potencia a disipar y también variaría según como montes la liquida, de todos modos, yo siempre he sido de poner los radiadores seguidos, ya sea en serie o paralelo, no bloque/radiador, bloque/radiador... porque así pierdes rendimiento, ya que estas intentando enfriar el agua 2 veces caliente y no 1 vez solo...
Yo pondría, bomba/cpu/gpu/radiadores en serie/depo/bomba...
Cuando la bomba es sumergida, si la pones en vertical, siempre será la parte alta la salida, y el otro racor (en este caso lo tienes directamente en el deposito de la bomba) por cualquier otro lado