Podrian ser varias cosas. Del procesador? si no es el disipador será un ruído eléctrico, como un chillido o algo asi? mi gráfica hace ese ruído en ciertos juegos y ciertas pantallas, pero no es nada preocupante (dependiendo de la pieza que lo haga y por qué...)
Tambien tengo un ventilador que tiene un poco de merda pegada por dentro y al rozar hace ruido, pero a los segundos curiosamente deja de hacerlo.