Acabo de probar a configurar mi vieja cuenta de hotmail en icedove (thunderbird para debian) y me ha detectado todo automáticamente con sólo poner mi dirección y contraseña. Cómo lo tienes configurado?
Edit: Veo que en tu primer mensaje dices algo de webmail y hotmail. Olvidate de esas extensiones, hotmail hace tiempo que soporta pop3.