Dejo aquí algo que he descubierto, no sabía que se podía.
Para jugar a Pokemon Opalo (supongo que es parecido con otros fangames de Pokemon de rpg maker) en la Steam Deck:
1-Descarga el Pokemon Opalo o cualquier otro
2-Entra al modo escritorio y abre Steam
3-Ve a la pestaña Productos y eliges la opción "Añadir un producto que no es de steam a mi biblioteca", seleccionando el archivo Game.exe de la carpeta del juego.
4-En Steam se da click derecho al Pokemon Opalo y selecciona Propiedades
5-Ve a la sección COMPATIBILIDAD, selecciona Forzar el uso de herramienta de compatibilidad, y eliges Proton 7.0-4 (es el único Proton con el que me funcionó, los demás no abrian o daba error)
6-Vuelves al Gaming Mode
7-En Steam selecciona el Pokemon Opalo y luego el icono que es un mando para ir a ajustes del mando.
8-Cambia la disposición actual haciendole click y seleccionando Disposiciones de la comunidad.
9-Elige la disposición Pokemon fangame creada por IvaCH.
10-Y listo
. Ya se puede abrir el juego y jugarlo en la Steam Deck desde el Gaming Mode.