Porque el boost depende de la temperatura, no solo de lo que tú pongas en el msi afterburner. Si la gráfica está más caliente, bien porque llevas un tiempo de pruebas, o bien porque con el boost que le has puesto se calienta más rápido, la frecuencia va a bajar, y también el rendimiento, en los casos más extremos por debajo del que tenías antes del overclock.
El furmark es un programa poco recomendable para probar el OC de gráficas modernas. Prueba con algún test más realista, como unigine heaven, y con los ventiladores bien altos, para que las temperaturas no te afecten.
Saludos