Lo que reportas es un error muuuuy común en los joycon, yo tramitaría la garantía.
Los míos por ejemplo que son los de la consola comprada de salida ya los mandé una vez a garantía después de 1 año de uso. Y no quedaron perfectos porque muy de vez en cuando se les va la olla pero luego vuelven a la normalidad a los pocos minutos, entre eso y estar 1 mes sin jugar por mandarlos a garantía, prefiero quedármelos.
Es muy raro aquel joycon que no termine fallando a los meses de uso, de pena la calidad de fabricación comparado con otros mandos de otras consolas (mi viejo mando de 360 por ejemplo que me vino con la consola allá en el 2011 sigue dando guerra como un campeón, ni una sola falla en todos estos años dándole caña).