No pasa nada, la OLED tiene de serie un protector de pantalla de plástico, lo puedes quitar y sustituir por uno idéntico, siempre que sea el oficial de Nintendo u Hori.
Nintendo dice lógicamente que no se quite, ya que ayuda en caso de rotura del vidrio a que no se generen daños, pero en consolas con arañazos yo los he sustituido por otros originales y no hay diferencia ninguna. El protector oficial de Nintendo (el que viene con una fundita) es 100% idéntico al que montan en la fábrica, y si sabes cambiarlo como se debe no notarás nada.