Wenas, yo conecto con el flashFXP sin problemas y lo he hecho tanto con win98 como con XP.
Recordad que para conectar la X con el PC, si teneis intalados algun tipo de cortafuegos debeis desconectarlos, pq os puede dar problemas para llegar a conectar o cuando os navegueis por los directorios de la X; pq yo en su momento tenia el norton internet segurity o el zonealarm(no me acuerdo) y me comi bastante la olla. Tambien decir que os asegureis que el cable de red este bien y os de ping(sobretodo si es cruzado). Y aunque supongo q ya lo sabeis, orden de arranque, 1º pc y 2º consola.
Espero q os sirva de algo, suerte!