En las opciones, la ultima pestaña, interfaz de usuario (si no la ves hay unos botoncitos con flechita para moverte y ver mas pestañas), abajo salen los skins. A mi me salen 6, 3 compactos (verde, azul, rojo) y 3 normales. Si no te salen no se que sera, mira la carpeta de instalacion (archivos de programas x86\msi afterburner\skins) a ver si estan los 6.
Uso la version 2.1.0, si sirven los skins de esa version para la que tu usas, instala la 2.1.0, copialos a otra carpeta, instala la nueva y metelos en la carpeta de skins a ver si rula.