segun mis pruebas yo jamas he podido hacerlo hasta hace poco que flashee la de mi hermano, lo que si recuerdo y puede que funcionase es poner el backup sin loader y arrancarlo directamente, reitero, sin LOADER de ningun tipo, con loader me refiero al menu de tu M3,Ez,G6 o lo que tengas, la unica vez que me funciono fue con un EZ flash II de 256megabits que tenia antiguo, y como solo carga GBA el backup previamente tubo que ser convertido a ese formato *.ds.gba. , y, al encenderlo, pasaba directamente a arrancar la rom sin nada de por medio, lo malo es que como el espacio es tan pekenyo en el flash no pude poner gran cosa, pero el metroid pinball por ejemplo salio bien.