Es respetable la opinión de mantener las iso's limpias, pero si tienes los UMD's no se que más limpias se puedan tener para hacer los backup por si algo sale mal, además también es bueno considerar que algunos plugin o parches a la flash0 (para poder correr los últimos juegos), en ocasiones dañan los savedatas, o mas bien, los savedatas obtenidos con plugins viejos no te sirven para plugins nuevos.
(Al menos a mi me gusta volver a jugara algunos juegos anteriores, no ando comprando el último juego al momento de que salga)