Hola tio, te cuento. Para aplicar los parches .PPF necesitas tres cosas: la ISO del juego (El Jak3 en este caso), el parche .PPF y el programa para aplicar el parche a la ISO, el PPF o Matic. Lo puedes descargar desde
AQUI. Una vez descomprimido verás que es tan sencilo como seleccionar en un cuadro la ruta donde tienes la iso, en otro la ruta donde tienes el parche PPF y darle al boton de aplicar parche (acuerdate de no tener protegida contra escitura la ISO).
Saludos!
muchas gracias de antemano 
