k va, para nada, tu crea la particion que a los juegos no les pasa nada. la creas o con ps2os(hasta de 2 gigas) o con el hddformat(el tamaño que kieras)
salu2
pd: ojo cuando borres alguna particion! mejor desde el ps2os, poniendo la vista de solo particiones compatibles, asi taseguras que no borras ningun jeugo