NTFS NT File System a grandres rasgos es el sistema de ficheros utilizado por microsoft desde Windows NT y que ha seguido utilizando con Win2000 y el patético XP. Se usa sobre todo en servidores para administrar permisos a carpetas, ficheros, recursos compartidos, etc Para hacer las copias de seguridad de PS2 no es necesario que uses NTFS a no ser que crees imagenes de tamaño superior a 4GB límite máximo de un fichero en FAT32(Win95,98,ME y demás variantes alienigenas). Normalmente los programas de grabación si creas una imagen al HD te la parten en varios trozos de 1GB. Sin embargo si vas hacer backups de DVD video sobretodo DVD5 si que necesitarás tener un SO con NTFS ya que vas a tener que trabajar con ficheros mayores de 4GB.
Un saludo.