El tema de tonto no tiene nada. Yo me estoy planteando cambiar el disco interno y el backup del disco antiguo a uno externo es un paso imprescindible.
Quizás sería conveniente además de respaldar las carpetas en el directorio GAMEZ, LAUN1234 o el que use vuestro manager, hacer un respaldo de la carpeta GAMES y de HOME/001/savedata para los saves y demás. Si el firmware es el mismo entiendo que restaurando todo a sus rutas debería funcionar... aunque no necesariamente.
¿Alguien ha intentado restaurar carpetas a sus ubicaciones tras un cambio de disco duro?.