Es posible que el HDD lo tengas formateado en NTFS que, por defecto, la PS3 no lo reconoce. FAT32 por defecto lo reconoce, pero con los limites de 4 GB máximo por archivo.
Creo recordar que existe un .pkg que permite el uso de NTFS en la PS3 para HDD externos, o versiones de Multiman que ya soportan NTFS.
Tambien puedes pasar las ISO por FTP a un PC, por red.