Hola.
Que va, para nada es un follón, a lo mejor lo parece al leerte los tutoriales pero luego te pones manos a la obra y resulta fácil, te lo digo yo que no tenía ni idea y a la primera me salió todo bien, con un lector Hitachi.
Mi consejo es que leas y te aprendas un poco el tutorial correspondiente a tu modelo de lector, luego desmontas la consola y conectas el lector al pc y ya pues es hacer los pasos con el Jungle.
Creo, y solo creo, que con el Jungle actual no hay problemas para poner el lector en modo B, es darle a una opción del programa y ya está, antes en versiones antiguas si que había que ponerlo con Slax si no recuerdo mal o también cogías, abrías la bandeja del lector, le quitabas la corriente desenchufándolo, lo volvías a enchufar y voilá, ya estaba en modo B, así lo hice yo.
Si no te ves capacitado o tienes poco tiempo (bajo mi punto de vista hay que dedicar unas horas a leer y aprenderse todo bien) llévalo a un sitio que te lo hagan Y por 30€ aproximadamente lo tienes.
Y por si acaso no lo sabes; el lector se alimenta de la propia consola, el otro conector que no es el SATA es el de corriente, enciende la consola con el cable de vídeo conectado también para que no se apague a los 5 minutos y le estarás dando corriente mientras duré el proceso de flasheado. 