El Passkey no tiene ningun problema, unicamente el de posibles virus, que si no te bajas roms de sitios extraños y demas puedes estar bastante seguro. La verdad es que flashear es mas comodo.
Para flashearla puedes poner tu M3, perfectamente. Sigue el manual al pie de la letra, yo tambien estaba acojonado pero todo fue a la perfeccion. Asegurate al puentearla que rascas un poco con la punta del destornillador, ya que tiene como una fina pelicula protectora y hay que quitarla, no se si me explico. Eso y lo de no apagarla.
Suerte!