En un server ubuntu creo q 9.04) que hay en una empresa en la q le hago servicio tecnico, me fije hoy, y tiene los permisos almacenados en /etc/samba/smb.conf
El administrador usa una utilidad grafica q se llama "samba server configuration" (la por defecto supongo)
Le pregunte, y me comento que cuando instalo un server mas antiguo, encontro el smb.conf en /usr/local/samba/lib/smb.conf