Nunca he usado YDL ni tp he compilado nunca el VLC (yo uso mplayer), así q podría equivocarme pero te diré lo que intuyo según lo que cuentas.
El fichero "announce" que mencionas no sé de donde lo habrás sacado pero seguramente será un fichero de texto explicando las novedades de esta versión o algo por el estilo. Prueba a abrirlo con tu editor de textos habitual.
En cuanto a como instalarlo, el método habitual (y según lo que leo en INSTALL tb en este caso) consiste en ejecutar:
./configure && make && sudo make install
Pero te recomiento que antes ejecutes:
./configure --help
para ver la lista de opciones que te ofrece y usar las que necesites (por ejemplo, las que has posteado antes). Esto es importante! Compilar con éxito y de manera eficiente depende mucho de como uses el script configure.
Si te sigue dando problemas, pega aqui lo de que te sale por pantalla. No debería faltarte ninguna dependencia si ya tienes instalada una versión anterior del programa.
PS: supongo que tienes "sudo" instalado y bien configurado. En caso contrario, tendrás que entrar como root para ejecutar el "make install" del final. Sobretodo, NO ejecutes esta línea si no estás seguro de que todo lo anterior a ido bien, porque te machacará el VLC que tienes instalado y podrías quedarte sin ninguno.