depende del chipset y de la tarjeta de video en si, algunas son solo compatibkles cuando es PCIEx16 1.1 mientras otras si soporta desde PCEx16 1.0. Prueba actualizar el BIOS y de colocar bien los cables de la fuente de poder a la tarjeta de video si es que los necesita e igual prueba conectar la entrada de voltaje extra que algunas tarjetas madre tienen para alimentar el puerto PCIEx16.
Tambien revisa en el BIOS que la prioridad del dispositivo de video este en AUTO o en el PCIE y no en el video integrado o tan solo reinicia el BIOS.