Tendras una unica particion para Linux, asi que la de sistema es tu "HD", asi deberias ver la de sistema y aparte la particion de Windows.
Y donde deberias meter tus cosas en la particion de sistema es en tu usuario en /Home , no te esta permitido tocar nada fuera de esa carpeta de usuario salvo que uses el password de administrador (y si tienes que usarlo ya sabes que es por que es delicado o no deberias), esto no es como en windows aqui hay seguridad.
De todas formas coincido con el compañero en que podrias poner una captura (tecla imprimir pantalla) de Gparted para que sepamos exactamente como tienes organizado el HD.