Bueno Compa-triota te recomiendo que veas si tienes activados cheats (No importa que no los uses) es necesario desactivarlos ya que hay algunos de ellos que traban el GTS No importando la flash (M3S/R4,M3/G6Real,etc,etc) ni el formato de los mismos (dat,xml,txt,cdb,etc,etc) y por lo regular traban el juego ahi...
Lo recomendable en este caso es que verifiques eso...Lo cual no tiene NADA que ver con los pokes que tengas en tu juego (Tengo miles de MUTANTES y eso no me impide usarlo) ya si en dado caso persiste el problema prueba usando otra version del juego o region a ver si lo corrige (aunque esto ultimo no lo creo)....