yo lo intenté hacer con 3 discos duros y no pude. Intenté deshabilitarlos desde la Bios, y nada, siempre me arrancaba el mismo disco duro.
Lo que si pude conseguir fue, instalar en un disco duro el W98 y luego con el WMe, y en otro disco duro tener el W2000. Al instalar el W2000, debes decirle que no quieres actualizar el W98, y después te dice en que partición o en que disco duro lo quieres.
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