Ambas versiones se pueden colocar en horizontal. Yo tengo un modelo con el rótulo de Wii "para la posición vertical" (Según dicen las que son "totalmente" compatibles con juegos de GameCube) y en el manual especifica que también puede ponerse en horizontal.
De hecho, yo lo prefiero porque en la posición vertical una rendija de ventilación queda hacia abajo, con la única ayuda de la base para tener una mínima abertura.