Mira a ver si en la página del flash cart tienen algun programa para arreglar la memoria (como en las de los discos duros).
Sino, busca programas que te analicen los discos duros (a veces windows no te reconoce un disco duro porque tiene mal la mbr o está la partición defectuosa; pero hay programas que si te la reconocen).
Ahora mismo no sabria que programas podrias usar, pero seguramente que buscando en google encuentres alguno. Yo como básico recomendaria el partition magic, pero creo que no trabaja con memorias USB, aunque por provar que no quede....
Hace tiempo me bajé un cd de reparación de discos duros y tal y venian herramientas (msdos) para borrar la mbr, hacer formateos a bajo nivel, analizar discos duros.... Hirens boot cd que puedes encontrar en la página de vagos.
Bueno y otra cosa que puede ser sea que tu ordenador ya no reconozca la tarjeta, si tienes acceso a otro ordenador intentalo desde ese.
Ya más no se me ocurre
Saludos y suerte