Yo lo he puesto y los wmv se me ven sin problema:
emerge -pv mplayer
These are the packages that would be merged, in order:
Calculating dependencies... done!
[ebuild R ] media-video/mplayer-1.0_rc1 USE="X aac alsa dvd dvdread fbcon gif gtk iconv jpeg mad (mmx) opengl png (sse) (sse2) unicode vorbis (-3dfx) -3dnow -3dnowext -aalib (-altivec) -amr -arts -bidi -bindist -bl -cdparanoia -cpudetection -custom-cflags -debug -dga -directfb -doc -dts -dv -dvb -enca -encode -esd -ggi -ipv6 -jack -joystick -libcaca -lirc -live -livecd -lzo -matrox -mmxext -musepack -nas -openal -oss (-real) -rtc -samba -sdl -speex (-svga) -tga -theora -truetype -v4l -v4l2 (-win32codecs) -x264 -xanim -xinerama -xv -xvid* -xvmc" LINGUAS="es -bg -cs -da -de -el -en -fr -hu -ja -ko -mk -nl -no -pl -pt_BR -ro -ru -sk -tr -uk -zh_CN -zh_TW"
Es en un amd64, mirate mis flags por si te pueden ser de utilidad.
Un Saludo.