Como supongo que sabrás, no se puede escribir en una partición NTFS, así que me imagino que tienes FAT. El sistema de archivos FAT no soporta atributos ni nada parecido a lo que se acostumbra con ReiserFS, XFS, etc. Supongo que lo que te sale es un mensaje de error del propio xMule. Creo que eso era un bug de esa versión, pero podías enmendarlo añadiendo al fstab la opción para la partición que uses con el xMule "quiet", tal que así:
/dev/hdxy /mnt/fat vfat users,quiet,......
También puedes actualizar el xMule por si era algún bug suyo (no lo recuerdo), aunque la última versión que ha salido (y saldrá) es la 1.7.0.
Saludos.