Pues se me acaba de ocurrir que le hagas un formateo a bajo nivel, lo malo es que destruye completamente todos los datos, por lo que deberas guardarlos antes.
Lo puedes hacer simplemente con una herramienta llamada HDD Low Level Format Tool gratuita que se encuentra facilmente buscando en guguel
Despues solo tienes que quitar el disco y enchufarlo, en otro puerto mejor, y windows te pedira que lo formatees, hay pon fat32 y prueba si funciona (primero vamos a ver si funciona asi, y si funciona pues ya veremos como podemos crear mas particiones)
Saludos