Éso depende solamente de ti, depende de si tienes tarjetas CF o SD, y si no tienes cuál prefieres, sinceramente, son más pequeñas las SD...
Pero pasa una cosa, con SC CF el tamaño de cartucho es como uno de GBA, peeeeeeero, la tarjeta Compact Flash sobresale bastante, y da miedo cargársela de un golpe... en cambio, SC SD sobresale el cartucho 1cm en comparación a uno de GBA, y tiene mejor acabado, yo te recomiendo la SC SD