Tu no puedes arreglarlo (a no ser que sepas C y te pongas a picar código para solucionarlo).
La diferencia entre ambos es el wiilinux tiene un driver y el que Mplayerwii utiliza el libogc. Creo que ya estaban viendo los desarrolladores del libogc para usar el driver del wiilinux.
Pero hasta que no saquen una solución, dudo que puedas hacer algo.