La razón por la que no se cargan al Joker de manera definitiva es que es un villano icónico, y es junto a Batman, la razón de ser tanto de los comics como del propio Batman. Sin él, Batman dormiría mas tranquilo, porque puede decirse que el 50% de los criminales de Gotham[incluidos Bane y Killer Croc, que son de los mas "Mudillos"] son unos criminales "Normalitos".
Pero el joker es un psicópata retorcido. Mata por placer, no "Lleva las cuentas" de sus víctimas[pero sabe que Batman
SI lo hace] y una de las razones que le llevan a comportarse así es tratar de hacer que Batman cruce la línea moral y se ponga a su mismo nivel, pero no para demostrar nada, sino solo por el mero hecho de divertirse habiendo "Roto" al murciélago.
Bane trató de hacer lo mismo[en la saga de KnightFall] pero por razones un tanto más básicas: Demostrar a Gotham que él había vencido al murciélago. Sin embargo Bruce volvió y las cosas se encauzaron. Pero el Joker conoce a Bruce Wayne y sabe que es Batman[aunque no lo delata] sabe donde tiene la Batcueva, donde encontrar a los miembros de la Bat-Familia y sabe que fibras tocar para hacer que Batman salte...Es posiblemente el villano que mejor conoce al "Mejor Detective del Mundo" y por eso, no lo matan de manera definitiva en ningún comic.
Aunque si que ha tenido multiples muertes en muchísimos comics:
En "El Regreso del Caballero Oscuros" muere con el cuello roto
En "El Regreso del Joker[Batman del Futuro] muere cuando Robin le dispara la banderilla de su pistola
En Injustice Superman le hace un "Fatality"
En Batman: Tormenta de Sangre, un Vampirizado Batman lo mata succionándole la sangre....
Para terminar hay que decir que en Gotham si que existe la pena de muerte, pero parece que no se aplica demasiado a menudo...
En Arkham Asylum: Living Hell, el comic dedicado a Warren White "El Tiburón Blanco" a este mismo tio el juez le da a elegir entre la pena de muerte o irse directamente a Arkhan, y claro, al final va a Arkham....
Que no se ejecute a mas villanos es una cosa, pero pena de muerte hay.