Pues la has liado un poco, más te valdría haber leído un poco más antes de instalarla.
Además de que te reconozca y añada las particiiones al fstab, tienes que poner arreglar el tema del arranque.
Supongo que windows lo tendrías en el primer disco duro, así que cuando lo vuelvas a poner, te arrancará directamente sin darte a elegir, así que tienes que instalar en él también el arranque de linux.
Un saludo.