Puede que la capturadora se detecte como una segunda tarjeta de sonido, para grabar de ella sonido tendrás que decirle a Windows que use esta. Mientras no le digas lo contrario grabará de la tarjeta de sonido de tu PC.
Y ojo en el caso de tarjeta de sonido no es lo mismo el Line-In que Mic-In, primero porque el microfono es mono, tiene un leve voltaje y puedes freirla o dañarla con el tiempo metiendole sonido amplificado (porque es para poner un microfono, por eso es Mic-In), aunque algunas tarjetas de sonido son digamos configurables al respecto.
