Problema al cerrar aplicaciones sin finalizarlas

Hola a todos, tengo un problema muy tonto, el otro dia cambie la barra de tareas en mi ubuntu 9.04, y estuve trasteandolo un poco, y ahora resulta que al cerrar aplicaciones tipio emesene, pidgin y mas no me aparece el tipico icono al lado del reloj, y si vuelvo a abrir por ejemplo el emesene me dice que ya estaba conectado desde otra ubicacion...

Lo que no entiendo es porque si cambio la barra de tareas de la parte superior a la inferior ya no me aparecen los iconos de dichas aplicaciones.

Decir que solian salir al lado del icono de red, el cual elimine y no volví a encontrar xD