Yo estoy en el mismo caso, actualizé a 3.52 M33 y desde entonces no puedo cargar .ISO, o no me aparecen en la PSP aunque restan capacidad a la MS (conectando la MS al PC si aparecen) o me da error por redundancia cíclica, algunos user me comunicaron que podía ser error de la tarjeta, como tengo 2 probé con la otra y pasaba lo mismo por lo que o es mucha coincidencia que se jodan las 2 MS a la vez o descarto el error del la MS.
En cuanto a lo de borrar la flash1 tambien lo hice, después bajé a la 3.40 y sigo igual, no se que paso pero me temo que la 3.52 hizo algo no muy bueno en mi PSP...