En la cobra bios , al menos en las ultimas q yo probe( 1.6 y 2.1) hay una opcion para la deteccion de apertura y cierre de la tapa. Ahora mismo no se exactamente como se llama, pero con poco q sepas de ingles... pues ya ta. Y en esa opcion tienes q poner la opcion para q use el sensor de la tapa normal , no que siempre la ponga como cerrada( si no recuerdo mal le llaman pass-thru o algo asi) .
Si ni con esa opcion, lo q yo hice es simplemente conectar directamente el lector al interruptor q detecta si la tapa esta abierta o no( atras a la derecha), y dejar los 2 conectores del viper sueltos.
Nota: por cierto supongo q para cambiar de DVD, aunq juegues sin carcasa, quitaras el interruptor y luego le volveras a dar no?, simulando apertura y cierre, pq si no la consola no puede saber si metiste el segundo DVD o no