Eso es que ha petado el índice de archivos y/o algún sector del disco. Si con el /r no mejora, te descargas una imagen de linux (ubuntu por ejemplo), la grabas en un cd, reinicias el equipo y en lugar de arrancar con windows, arrancas con linux desde el cd. Desde ahí podrás ver qué hay en el disco sin pasar por la "censura" del explorador de windows. Si aún así no hay manera, puedes probar con algún programa para recuperar archivos borrados y particiones eliminadas, suelen recuperar bastantes cosas.
Suerte.