Eso de las pistas (tracks) no es para que suene una después de otra sino para poder tener audio en varios idiomas. Si en los plugins del avidemux no hay nada para repetir el audio, lo que puedes hacer es editar el archivo de audio con algún programa antes de pasarlo al avidemux. Podrías hacerlo con audacity, por ejemplo, y le pones un fade-out al final o lo que quieras.