Eso me pasó a mi ^^
NO te preocupes que tiene facil arreglo.
Debes poner el save que encontrarás en la página de darkfader, en concreto el de tu juego, debes ponerlo, renombrado a passme2.sav a la carpeta \SAVER
Luego, SIN el passme metido enciendes la DS con el EZ4 puesto (con el flashme, el save (passme2.sav) y el archivo de actualización si aun no lo has hecho, aunque leo que si...por cierto el punto 4 tuyo es mentira, puedes dejar de pulsar el botón R una vez ha empezado.
Cuando hayas encendido aparecerá un mensaje fugaz que dirá: saving o algo así... Despues de ésto, SIN apagar la DS pones el passme 2 con el juego ya metido y reinicias la DS y estás en modo DS, luego cargas el flashme y listos, SUERTE!!