BitTornado no es "controlable" directamente, pero con un poco de maña se puede hacer, no es tan cómodo como el ML pero bueno. Trae un script llamado "btdownloadmany" que una vez que está ejecutándose puedes "echarle" torrents en un directorio (por SMB, por ejemplo) y te los agarra él solo. Aparte de eso solo necesitas una sesión SSH para comunicarte con la máquina y pararlo, mirar la velocidad, si el archivo está completo, etc.
Saludos.