Entonces será el emulador de N64 de Wii U, yo como solo tengo este de N64 no puedo ver si es con todos los de N64,pero veo que tu si tienes mas de N64,de Snes,GBA,etc no ocurre así que será el emulador.
Espero que Nintendo lo arregle ya que es muy molesto jugar así en el WiiU Gamepad,en la TV va bien solo es en Gamepad.
Un saludo.